Tuy nhiên, giữa chúng cũng có sự khác biệt. Cụ thể: tài sản là khối lượng của cải của một chủ thể ở một thời điểm nào đó còn thu nhập là số của cải thu được của một chủ thể trong một khoảng thời gian nhất định. Như vậy, thu nhập của một thời kỳ sẽ không bao gồm tài sản ở thời kỳ trước đó cộng lại. 

Vì vậy, khái niệm tài sản phải gắn liền với yếu tố thời điểm còn khái niệm thu nhập gắn với yếu tố khoảng thời gian nhất định. Cùng là thuế thu nhập nhưng đối tượng chịu thuế của thuế TNDN khác hẳn với đối tượng chịu thuế của thuế thu nhập cá nhân, thể hiện ở tên gọi của từng loại thuế. Đối với thuế TNDN, đó là thu nhập của tổ chức có được từ hoạt động sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ, còn đối với thuế TNCN là từ thu nhập của cá nhân. 

Dựa vào đối tượng nộp thuế, nhà nước đã phân chia thành hai loại thuế khác nhau để việc đánh thuế được công bằng và hiệu quả. Có thể thấy đối với tổ chức, mục đích thành lập và hoạt động là để sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ nhằm tìm kiếm lợi nhuận nên thu nhập của tổ chức chủ yếu là thu nhập phát sinh từ hoạt động sản xuất, kinh doanh. Còn đối với cá nhân, thu nhập rất đa dạng, không chỉ là thu nhập từ hoạt động sản xuất, kinh doanh mà có thể là thu nhập tiền lương, tiền công,… Hơn nữa, là một thuế trực thu, thuế TNDN còn có đối tượng tính thuế khác hẳn với đối tượng tính thuế của bất cứ một loại thuế gián thu nào.

Nếu như đối tượng tính thuế của thuế giá trị gia tăng hay thuế tiêu thụ đặc biệt là một phần thu nhập của người chịu thuế được đưa vào tiêu dung, thì thuế TNDN đánh vào thu nhập của chủ thể nộp thuế ở giai đoạn tích lũy. Thuế TNDN ảnh hưởng trực tiếp đến lợi ích kinh tế của doanh nghiệp nên hành vi gian lận thuế xảy ra rất phổ biến. Ở các nước, hệ thống thuế có nhiều loại thuế khác nhau nhưng suy cho cùng thì bất kì loại thuế nào cũng đều lấy từ thu nhập của dân cư trong xã hội để tập trung vào quỹ ngân sách nhà nước. 

Vì vậy, trên phương diện lý thuyết thì Nhà nước chỉ cần đánh thuế thu nhập là đủ nhưng chỉ đánh thuế thu nhập thì mức thuế suất sẽ rất cao, tạo cảm giác bề ngoài về việc đánh thuế cao vào thu nhập sẽ là sự thiếu công bằng. Hơn nữa, nếu chỉ đánh thuế vào thu nhập thì khả năng rủi ro về thất thu sẽ cao, đặc biệt ở những quốc gia mà diện đánh thuế thu nhập còn hẹp, trình độ quản lý thuế còn hạn chế. Do đó, việc đánh thuế dưới các dạng khác nhau đối với thu nhập sẽ tạo điều kiện thuận lợi thì thực hiện và đạt hiệu quả thu thuế cao.